培養プレートのコスト

2019.09.25 Wednesday 22:55
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    線虫の研究って、初期コスト(顕微鏡など)がかかるけど、ランニングコストは安いはずなんです。

     

    変異体とってマップングと次世代シークエンスすると、taqと次世代シークエンスのお金が必要だけど、普通に交配させて、タンパク質の局在みたりするのは、、あんまりお金はかかりません。

     

    それで何に一番お金がかかるかというと、、線虫用の培養プレートですかね。

    寒天はたかくて、BDだと454グラムで3万円くらい、シャーレがファルコン社だと500枚入りで1万4千円くらい。

    大体一回で、280枚つくるので、チョット計算してみると

     

    14000円/500=28円(シャーレ)

    BDの寒天だと

    51(280枚分/454g)×32000円/280=12.8円(約13円)

    ペプトンとかコレステロールはほぼ誤差範囲。

     

    28円+13円=41円 

    大体1枚あたり40円くらい。

     

    1000枚も使えば、4万円くらい。それなりに結構するわけです。

     

    そこで有明高専にきて、コストダウンを図りました。

    シャーレは某メーカーの500枚で4200円のものに変えました。

    また寒天も伊奈食品工業の7000円のものにしました。

    そうすると

    4200円/500=8.4円(シャーレ)

    伊奈食品工業の寒天だと

    51(280枚分/500g)×7000円/280=2.5円

    8.4円+2.5円=11円 

    大体1枚あたり11円くらい。

     

    大幅なコストダウン!!

     

    理研時代の元ボスは、絶対にBDの寒天がいい、仰っていましたが、まあ、伊那工業の寒天でも問題なさそうだし、伊那工業の寒天にしました。これで変異体のスクリーニングもコストを気にしないですみます。あとBDが454グラムという中途半端なグラム数は、ポンド基準の重さなのかな。。

    アメリカにいたときはポンド表示に慣れていなくて、え、、この牛肉、高いの、安いの?と迷っていました。

     

    ちなみに、もっとやすいダイエット用寒天だと、、線虫が育たないのですよ。。なんで??

    食品用なので有害なものはないと思うのですが、食品寒天で作ったプレートだと、なんとなく線虫が干からびている感じなので、寒天内の水分量が線虫によくないですかね。

    誰か正解を知っていたら教えて下さい。

     

    伊那食品工業って、

    たしか、トヨタも目標にしているとか新聞記事で読んだことがあるけど、50期連続増収増益の会社らしい。すごい手腕ですね。

     

     

     

     

     

     

     

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    助成金に採択!

    2019.09.04 Wednesday 06:42
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      武田科学振興財団の研究助成に採択されました。

       

      2017年に有明高専に異動した時に、武田の研究助成金に応募しようと思ったら、高専からは出せなかったんですよ。

      その時に武田科学振興財団に電話して、以前採択されたことがあるのですが、高専に異動した場合は応募できないのですか?と聞いた覚えがあります。

      結局、2017年度は高専からは出せなくて(高専は応募できるカテゴリーがなかった)、あの時は、本当に悲しかったな。。。自分はライフサイエンスの研究をしている機関にいないんだ、、と言われているようで。。

       

      それがなんとですね、武田科学振興財団は、規約を変えてくれて、武田のライフサイエンスの研究助成は高専からも応募できるようになったのです!!

      武田科学振興財団、めっちゃ懐が広い!!!

       

      今年に入って、科研費や複数の助成金に採択されていてめっちゃ調子いいです。

      これはやっぱり、おみくじ凶のご利益ですかね。

       

      でも科研費や助成金が採択されると、プレッシャーもあるし、あとこの好循環(論文出す→研究費採択→論文出す→研究費採択)を上手く回さないと、、と思って、色々と考えるのですが、やっぱり、単純にすっごく嬉しいです!

       

      今日も、頑張って顕微鏡を覗こう!

       

       

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      研究室の宝物

      2019.05.15 Wednesday 19:00
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        大隅基礎科学創成財団の贈呈式で、大隅先生にサインを頂きました!

        1人でもらいに行くのは恥ずかしかったので京都大学、東京工業大学、東京大学の先生に声をおかけして、皆さんで貰いに行きました。気さくにサインをいただき、さらに2ショット写真まで撮っていただきました。

         

         

         

        研究室の一番目立つところに大切に飾りました。

        研究室にはもう一つノーベル賞科学者のサインがあって、線虫の細胞系譜を同定したサルストン博士のサインです。

        これも研究室に大事に飾っています。

         

        また贈呈式でATP合成酵素の研究でご高名な吉田賢右先生と色々とお話できたのが、大きな収穫でした。

        私の見ている現象はエネルギーをつかわない限り起こりえないはずだと指摘されて、細胞外にはエネルギーを供給するシステムはないのにどう説明できる?と指摘をうけました。

        確かにそうなんです。私の仮説が正しいならば、エネルギーをどっかから持ってこないと局在のパターンが形成されないわけなんです。この局在パターンの成立にはエネルギー使ってないのかな??でも能動的にパターンが決まっているように観察されるんだよなあ。本当に不思議です。。。。

         

        ノーベル賞、、とまでは言いませんが、教科書に残る仕事がしたいな、といつも思っています。

         

         

         

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        MojavaでCS5は動く。。

        2019.01.07 Monday 20:41
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          年末に研究室のmacを Mojaveにアップグレードしました。

          CS5のフォトショップとイラストレーターを使っているので本当はアップグレードしたくなかったのですが、、諸事情によりアップグレードに踏み切りました。

           

          つかえるのかな、、と思っていましたが、なんと2つとも使えます!!

           

          ただイラストレーターは、終了時に必ず、予期しない理由で終了しました、となるのですが、あるサイトに掲載してあった機能拡張フォルダ中の “Services.aip” をプラグインフォルダの外へを試してみると、あれ、不思議、普通に終了できるようになりました。

           

          またフォトショップは、画面内に文字が入力できなかったのですが、環境設定、テキスト、テキストオプションを全てチェックを外したら、入力できるようになりました。多分、何かのフォントがプレビューの段階でエラーを起こしているのでしょう。

           

          とにかく、これでMojaveでCS5が使えたので一安心です。

           

          ただ、これ、サポート外なので何かあっても自己責任なので、きをつけてください。

           

          あとは、Photoshopが終了時にでてくる、photoshopが予期しない理由で終了しました。

          をなんとかしたいです。

          イラレは直せたのになあ。。だれかフォトショップでの直し方を教えてください。

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          美味しいお米。森のくまさん!

          2018.11.22 Thursday 20:00
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            最近、やたらと低アミロース米である、森のくまさん、のいい評判を聞くので、そしたら本当に美味しいのか調べてやろうじゃないかって事で、有明高専の生物愛好会と一緒に食味のテストをしました。

            低アミロース米がなにか?知りたい学生は環境生命コースに入って、学んでくださいね!

             

            下記のお米を全て炊いて、ブラインドで食味を比べ、愛好会の学生と一緒に評価をしました。

            やっぱり森のくまさん、美味しいのですね。学生のなかで一番人気でした。下の表の左側が順位です。

            あと、パックのお米が不人気でした。便利なんですけどね。。。

            私はパックを電子レンジで温めて、ふりかけ、、で、結構食べています。

             

            また、ついでに世の中で、コシヒカリ、と記載されているお米が、本当にコシヒカリなのか?調べてみよう、ということで生物愛好会の学生と一緒にPCRで調べてみました。これはコシヒカリ鑑定団 Ver.2 ビジョンバイオ販売のキットを使って調べてみました。この会社は久留米にあるんですね。このキット、便利ですね。もっと安ければ学生実験にも使ってみたいです。(ちなみにこの実験の費用はバイテク普及会からサポートされています)

             

            さて、これがその結果です。

             

            ミルキークイーンは、このキットではコシヒカリと判別不可なので、妥当な結果です。

            驚いたのが、パックのお米は全て判別できないんですよね。これはパックに詰めたお米を高温、高圧などで滅菌しているから、DNAが壊れているのかな、、と学生たちは推測していました。パックのお米を作るときって、そんなに高温かけるのかな?

             

            あと、ローソンのおにぎり、コシヒカリと記載してあるものは全部こしひかり、セブンイレブンの厳選米と記載されているものもコシヒカリでした。コンビニのおにぎりをよく買う私は、なんとなく安心した一日でした。

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